Древние кости в горах скрывали тайну: как расшифровка ядерного генома изменила взгляд на неандертальцев

В 1938 году у подножия гор на юго-западе Узбекистана археологи из отряда Алексея Окладникова нашли в гроте Тешик-Таш костяк ребенка. Возраст погибшего оценили в 8-12 лет. Позже антропологи установили: это неандерталец с черепом, указывающим на объем мозга, превышающий средний показатель для вида. Рядом с останками лежали рога сибирского горного козла. Часть специалистов трактует этот набор как символическое подношение, предшествующее захоронению. Другие усомнились в самом факте преднамеренного погребения.
ДНК из этой находки пытались прочитать давно. В 2007 году группа Сванте Паабо секвенировала лишь митохондриальный геном. Данных было мало, но они позволили предположить, что образцы принадлежат неандертальцу. Ядерный геном достать не удалось: в библиотечных образцах доминировала ДНК современных людей, перекрывавшая целевой сигнал.
Проблему решили биоинформатики. Бенжамин Петер из Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка и коллеги создали инструмент admixslug. Алгоритм позволяет выделять целевые последовательности в фоне мощного современного загрязнения, даже когда качество прочтения генома крайне низкое. Сперва метод проверили на неандертальце из Мезмайской пещеры (примерно 45 тыс. лет назад). Результат был стабильным.